>NC_002645_HCoV-229E_inf-1_M_24995..25672_678bp ATGTCAAATGACAATTGTACGGGTGACATTGTCACCCATTTGAAGAATTGGAATTTTGGT TGGAATGTTATTCTAACCATATTCATTGTTATTCTTCAGTTTGGACACTATAAATACTCC AGATTGTTTTATGGTTTGAAGATGCTTGTACTGTGGCTTCTTTGGCCACTCGTACTTGCT TTGTCAATCTTTGACACCTGGGCTAATTGGGATTCTAATTGGGCCTTTGTTGCATTTAGC TTTTTTATGGCCGTATCAACACTCGTTATGTGGGTGATGTACTTCGCAAACAGTTTCAGA CTTTTCCGACGTGCTCGAACTTTTTGGGCATGGAATCCTGAGGTTAATGCAATCACTGTC ACAACCGTGTTGGGACAGACATACTATCAACCCATTCAACAAGCTCCAACAGGCATTACT GTGACCTTGCTGAGCGGCGTGCTTTACGTTGACGGACATAGATTGGCTTCAGGTGTTCAG GTTCATAACCTACCTGAATACATGACAGTTGCCGTGCCGAGCACTACTATAATTTATAGT AGAGTCGGAAGGTCCGTAAATTCACAAAATAGCACAGGCTGGGTTTTCTACGTACGAGTA AAACACGGTGATTTTTCTGCAGTGAGCTCTCCCATGAGCAACATGACAGAAAACGAAAGA TTGCTTCATTTTTTCTAA >NC_005831_HCoV-NL63_AmsterdamI_M_25442..26122_681bp ATGTCTAATAGTAGTGTGCCTCTTTTAGAGGTTTATGTCCATTTACGTAACTGGAACTTT AGTTGGAATTTAATTCTAACGCTTTTTATAGTTGTGTTGCAGTATGGGCATTATAAGTAT AGCAGACTTCTTTATGGTTTAAAGATGTCTGTTTTATGGTGTTTATGGCCACTTGTTCTA GCTTTGTCTATTTTTGACTGTTTTGTCAATTTTAATGTGGACTGGGTCTTTTTTGGTTTT AGTATTCTTATGTCTATTATTACACTTTGTTTATGGGTTATGTATTTTGTTAATAGTTTC AGACTTTGGCGCCGTGTTAAAACTTTTTGGGCTTTTAATCCTGAAACTAATGCAATCATC TCTCTCCAGGTTTACGGACATAATTATTACTTACCGGTGATGGCTGCACCTACAGGTGTT ACATTAACACTTCTTAGTGGTGTACTTCTTGTTGATGGCCATAAGATTGCTACTCGTGTT CAAGTGGGTCAGTTGCCTAAATATGTAATAGTTGCTACGCCTAGTACCACAATTGTTTGT GACCGTGTTGGTCGCTCTGTTAATGAAACAAGCCAGACTGGTTGGGCATTCTACGTCCGT GCTAAACATGGTGATTTTTCTGGTGTTGCCTCTCAGGAGGGTGTTTTGTCAGAAAGAGAG AAGTTGCTTCATTTAATCTAA >NC_002306_TGEV_PUR46-MAD_M_26116..26904_789bp ATGAAGATTTTGTTAATATTAGCGTGTGTGATTGCATGCGCATGTGGAGAACGCTATTGT GCTATGAAATCCGATACAGATTTGTCATGTCGCAATAGTACAGCGTCTGATTGTGAGTCA TGCTTCAACGGAGGCGATCTTATTTGGCATCTTGCAAACTGGAACTTCAGCTGGTCTATA ATATTGATCGTTTTTATAACTGTGCTACAATATGGAAGACCTCAATTCAGCTGGTTCGTG TATGGCATTAAAATGCTTATAATGTGGCTATTATGGCCCGTTGTTTTGGCTCTTACGATT TTTAATGCATACTCGGAATACCAAGTGTCCAGATATGTAATGTTCGGCTTTAGTATTGCA GGTGCAATTGTTACATTTGTACTCTGGATTATGTATTTTGTAAGATCCATTCAGTTGTAC AGAAGGACTAAGTCTTGGTGGTCTTTCAACCCTGAAACTAAAGCAATTCTTTGCGTTAGT GCATTAGGAAGAAGCTATGTGCTTCCTCTCGAAGGTGTGCCAACTGGTGTCACTCTAACT TTGCTTTCAGGGAATTTGTACGCTGAAGGGTTCAAAATTGCAGGTGGTATGAACATCGAC AATTTACCAAAATACGTAATGGTTGCATTACCTAGCAGGACTATTGTCTACACACTTGTT GGCAAGAAGTTGAAAGCAAGTAGTGCGACTGGATGGGCTTACTATGTAAAATCTAAAGCT GGTGATTACTCAACAGAGGCAAGAACTGATAATTTGAGTGAGCAAGAAAAATTATTACAT ATGGTATAA >NC_003436_PEDV_CV777_M_25682..26362_681bp ATGTCTAACGGTTCTATTCCCGTTGATGAGGTGATTGAACACCTTAGAAACTGGAATTTC ACATGGAATATCATACTGACGATACTACTTGTAGTGCTTCAGTATGGCCATTACAAGTAC TCTGTGTTCTTGTATGGTGTCAAGATGGCTATTCTATGGATACTTTGGCCTCTTGTGTTG GCACTGTCACTTTTTGACGCATGGGCTAGCTTCCAGGTCAACTGGGTCTTTTTCGCTTTC AGCATCCTTATGGCTTGCATCACTCTTATGCTGTGGATAATGTATTTTGTCAATAGCATT CGGTTGTGGCGCAGGACACATTCTTGGTGGTCTTTCAATCCTGAAACTGACGCGCTTCTC ACTACTTCTGTGATGGGCCGACAGGTCTGCATTCCAGTGCTTGGAGCACCAACTGGTGTA ACGCTAACACTCCTTAGTGGTACATTGCTTGTAGAGGGCTATAAGGTTGCTACTGGCGTA CAGGTAAGTCAATTACCTAATTTCGTCACAGTCGCCAAGGCCACTACAACAATTGTCTAC GGACGTGTTGGTCGTTCAGTCAATGCTTCATCTGGCACTGGTTGGGCTTTCTATGTCCGG TCAAAACACGGCGACTATTCAGCTGTGAGTAATCCGAGTGCGGTTCTCACAGATAGTGAG AAAGTGCTTCATTTAGTCTAA >DQ811787_PRCV_ISU-1_M_25083..25868_786bp ATGAAGATTTTGTTGATATTAGCGTGTGCGATTGCATGCGCATGTGGAGAACGCTATTGT GCTATGCAAGAAACAGGTTTGTCATGTCGCAATAGCACAGTGTCTGATTGTGAGTCATGC TTCAACGGAGGCGATCTTATTTGGCATCTTGCAAACTGGAACTTCAGCTGGTCTATAATA TTGATCATTTTTATTACTGTGCTACAATATGGAAGACCTCAATTCAGCTGGTTCGTGTAT GGCATTAAAATGCTTATAATGTGGCTATTATGGCCCATTGTTTTGGCTCTTACGATTTTT AATGCATACTCGGAATACCAAGTTTCCAGGTATGTAATGTTCAGCTTTAGTATTGCAGGT GCAATTGTTACATTTGTACTCTGGATTATGTATTTTGTAAGATCCATTCAGTTGTACAGA AGGACTAAGTCCTGGTGGTCTTTCAACCCTGAAACTAATGCAATTCTTTGCGTTAGTGCA TTAGGAAGAAGCTATGTGCTTCCTCTCGAAGGTGTGCCAACTGGTGTCACTCTAACTTTG CTTTCAGGGAATTTGTACGCTGAAGGGTTCAAAATTGCAGGTGGTATGAACATCGACAAT TTGCCAAAATATGTAATGGTTGCATTACCCAGCAGGACTATAGTCTACACACTTGTTGGC AAGAAGTTGAAAGCAAGTAGTGCGACTGGATGGGCTTACTATGTAAAATCTAAAGCTGGT GATTACTCAACAGAGGCAAGAACTGATAATTTGAGTGAGCAAGAAAAATTATTACATATG GTATAA >AY994055_FIPV_79-1146_M_26213..27001_789bp ATGAAGTACATTTTGCTAATACTCGCGTGCATAATTGCATGCGTTTATGGTGAACGCTAC TGTGCCATGCAAGACAGTGGCTTGCAGTGTATTAATGGCACAAATTCAAGATGTCAAACC TGCTTTGAACGTGGTGATCTTATTTGGCATCTTGCTAACTGGAACTTCAGCTGGTCTGTA ATATTGATTGTTTTTATAACAGTGTTACAATATGGCAGACCACAATTTAGCTGGCTCGTT TATGGCATTAAAATGCTGATCATGTGGCTATTATGGCCTATTGTTCTAGCGCTTACGATT TTTAATGCATACTCTGAGTACCAAGTTTCCAGATATGTAATGTTCGGCTTTAGTGTTGCA GGTGCAGTTGTAACGTTTGCACTTTGGATGATGTATTTTGTGAGATCTGTTCAGCTATAT AGAAGAACCAAATCATGGTGGTCTTTTAATCCTGAGACTAATGCAATTCTTTGTGTTAAT GCATTGGGTAGAAGTTATGTGCTTCCCTTAGATGGTACTCCTACAGGTGTTACCCTTACT CTACTTTCAGGAAATCTATATGCTGAAGGTTTCAAAATGGCTGGTGGTTTAACCATCGAG CATTTGCCTAAATACGTCATGATTGCTACACCTAGTAGAACCATCGTTTATACATTAGTT GGAAAACAATTAAAAGCAACTACTGCCACAGGATGGGCTTACTACGTAAAATCTAAAGCT GGTGATTACTCAACAGAAGCACGTACTGACAATTTGAGTGAACATGAAAAATTATTACAT ATGGTGTAA >NC_009657_BtCoV-G1_BtCoV/512/2005_M_25678..26361_684bp ATGTCTTCGAACCAATCCGTTCCTGTAGAGGAGGTGATTAAACACCTCAGAAATTGGAAC TTTTCATGGAATATCATACTTACAATACTCTTAGTAGTGTTGCAGTATGGACATTACAAA TATTCCAGGGTTCTCTATGGCTTAAAGATGGCCATTCTTTGGCTTCTTTGGCCACTTGTT CTGGCCCTTTCCATCTTTGATGCCTGGGCCAGTTTTAATGTTAATTGGGTTTTCTTCGCA TTCAGCATCCTAATGGCCTGCGTCACAGCTGTGCTGTGGATTATGTACTTTGTTAACAGT ATCAGGTTGTGGCGACGCACCCATTCTTGGTGGTCCTACAATCCTGAAACGGACTCTATT CTGTCTGTCTCTGTGCTGGGTCGGCATGTCTGCCTACCAATACTTGGTGCACCCACGGGC GTAACGCTCACACTGCTTAATGGCACATTGCTTGTAGAAGGCTATCAGGTTGCTACTGGC GTACAGGTAAATAATTTACCTGGTTACGTAACAGTCGCCAAAGCTTCAACAACAATTGTC TACCAGCGTGTGGGACGTTCCATGAATGCAAATTCAAGTACTGGCTGGGCTTTCTTCGTG AAGTCCAAGCATGGCGACTACTATGCTGCTGCGAATCCAACAGAGGTTGTAACAGATAGT GAGAAAATTCTACATTTAGTCTAA >EF203064_Bat-CoV-HKU2_HKU2/GD/430/2006_M_24768..25457_690bp ATGAGTTCTAATTCTACTGAGTCGGTCCCTGTGACCGAAGTTTTAGAACATCTTAGGAAC TGGAACTTCAGTTGGAATATTATACTGACAGTATTCATTGCAGTGCTTCAATATGGTAAT ATGAAGTACAGTTTCTTCCTCTATGGAGTTAAGATGTTGATCATGTGGCTTTTATGGCCC TTAGTCATTGCTTTGAGCATTTTTAATGCCTATGCTGACTTTGGTGTCAATTGGTGGTTC TTCTCCTTCAGCATTCTGATGCTTGTCATAACGCTAGTTCTCTGGCTTATGTACATAATT AATAGTTTTAAGCTTTATCGCAGAACGCGAACGTTTTGGGCATTTAACCCCGAAACAGAC GCCATTGCTGTCATTTCAGTCTTTGGTAGGTCCTACTCGATACCTATGCCAGTGGCACCA ACAGGTATTACTCTGACGATCTTAAGTGGAACACTCTTTTTCGATGGCATCAGAATTGCT ACTGGTGTGCAGCCTGCACACTTACCGCAATTTGTGACTGTCGCCAAACCTGGCACGACT ATAATTTATACTCGTGCGGGGCGTTCCCTTAATGCAAGCACCAACACTGGTTGGGCTTTT TATGTCAGAAGTAAGCATGGTGACTATTCTGCTTTATCAAATAGTAGTGATAACTTGACA GAAAATGACAGATTGCTGCATTTAGTCTAA >NC_005147_HCoV-OC43_OC43_M_28402..29094_693bp ATGAGTAGTAAAACTACACCAGCACCAGTTTATATCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAA TTCCTAAAGGAATGGAATTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAATCATATTG CAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGATTATTTTGTGG CTTATGTGGCCCCTTACTATAATCTTAACTATTTTCAATTGCGTATACGCATTGAATAAT GTGTATCTTGGCCTTTCTATAGTTTTTACCATAGTGGCCATTATTATGTGGATTGTGTAT TTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTTTTGGAGTTTCAACCCAGAA ACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAAGGAACAATGTATGTTAGGCCGATAATTGAG GACTATCATACTCTGACGGTCACAATAATACGCGGCCATCTTTACATTCAAGGTATAAAA CTAGGTACTGGCTATTCTTTGGCAGATTTGCCAGCTTATATGACTGTTGCTAAGGTTACA CACCTGTGCACATATAAGCGTGGTTTTCTTGACAGGATAAGCGATACTAGTGGTTTTGCT GTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGC ATGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAA >NC_006577_CoV-HKU1A_N1_M_27633..28304_672bp ATGAATAAATCTTTTCTTCCTCAATTTACTTCTGATCAAGCTGTTACATTCTTAAAAGAA TGGAATTTCTCTTTGGGTGTAATACTACTTTTTATTACTATCATATTGCAGTTCGGTTAT ACGAGCCGTAGTATGTTTGTTTATCTTATCAAGATGATTATTCTTTGGCTTATGTGGCCA TTGACTATCACCTTGACTATATTTAATTGTTTTTATGCTTTGAATAATGCTTTTCTTGCA TTTTCTATAGTGTTTACTATTATTTCTATTGTTATATGGATTCTTTATTTTGTTAATAGT ATTCGGCTTTTTATTAGAACTGGCAGTTGGTGGAGTTTTAATCCAGAGACCAATAATCTT ATGTGTATTGATATGAAAGGCAAGATGTTTGTTAGGCCAGTTATTGAGGACTATCACACA TTAACTGCTACTGTTATTCGTGGTCATCTTTATATACAGGGTGTCAAACTTGGCACTGGT TATACTCTTTCAGATTTGCCCGTATATGTTACTGTAGCTAAGGTGCAAGTACTTTGTACC TATAAACGTGCCTTTTTAGATAAGTTAGATGTTAATAGTGGTTTTGCTGTTTTTGTTAAG TCTAAAGTTGGTAACTATCGTTTACCGTCTAGTAAACCTAGTGGTATGGATACTGCCTTG TTAAGAGCTTAA >AY884001_CoV-HKU1B_N2_M_27522..28193_672bp ATGAATGAATCAATTTTTCCTCATTGGAATTCTGATCAAGCTATTACATTCTTAAAAGAA TGGAATTTCTCTTTGGGTGTAATATTACTTCTCATTACTATCATACTGCAGTTTGGTTAT ACGAGTCGTAGTATGTTTGTTTATCTTATTAAGATGATTATTCTTTGGCTTATGTGGCCA TTGACCATTATCTTGACTATATTTAATTGCTTTTATGCTTTGAATAATATCTTTCTTGGG CTTTCTATACTGTTTACTATTATTTCTATTGTTATATGGATTTTATATTTTGTCAACAGT ATTCGGCTTTTTATCAGAACTGGCAGTTGGTGGAGTTTTAACCCAGAGACTAATAATCTT ATGTGTATTGATATGAAAGGTAAGATGTATGTTAGGCCAGTTATTGAGGACTATCATACA TTAACGGCTACTGTTATCCGTGGTCATCTTTATATACAGGGTGTTAAACTTGGCACTGGT TACACGCTTGCCGATTTGCCTGTTTATGTTACTGTAGCTAAGGTGCAAGTCCTCTGTACT TATAAACGTGCCTTTTTAGATAAGTTAGATGTTAATAGTGGTTTTGCTGTTTTTGTTAAG TCTAAAGTTGGTAACTATCGTTTACCTTCTAGTAAATCTAGTGGTATGGATACTGCCTTG TTGAGAGCTTAA >DQ339101_CoV-HKU1C_N5_M_27462..28133_672bp ATGAATGAATCAATTTTTCCTCATTGGAATTCTGATCAAGCTATTACATTCTTAAAAGAA TGGAATTTTTCTTTGGGTGTAATATTACTTCTTATTACTATCATACTGCAGTTTGGTTAT ACGAGCCGTAGTATGTTTGTTTATCTTATTAAGATGATTATTCTTTGGCTTATGTGGCCA TTGACCATTATCTTGACTATATTTAATTGCTTTTATGCTTTGAATAATGTCTTTCTTGGG CTTTCTATACTGTTTACTATTATTTCTATTGTTATATGGATTTTATATTTTGTCAACAGT ATTCGGCTTTTTATCAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTTAATCCAGAGACTAATAATCTT ATGTGTATTGATATGAAAGGTAAGATGTATGTTAGGCCAGTTATTGAGGACTATCATACA TTAACGGCTACTGTTATCCGTGGTCATCTTTATATACAGGGTGTCAAACTTGGCACTGGT TACACGCTTGCCGATTTGCCTGTTTATGTTACTGTAGCTAAGGTGCAAGTCCTCTGTACA TATAAACGTGCCTTTTTAGATAAGTTAGATGTTAATAGTGGCTTCGCTGTTTTTGTTAAG TCTAAAGTTGGTAACTATCGTTTACCTTCTAGTAAATCTAGTGGTATGGATACTGCCTTG TTGAGAGCTTAA >NC_003045_BCoV_BCoV-ENT_M_28691..29383_693bp ATGAGTAGTGTAACTACACCAGCACCAGTTTACACCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAA TTCCTAAAGGAATGGAACTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAGTCATATTG CAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGGTCATTTTGTGG CTTATGTGGCCCCTTACTATCATCTTAACTATTTTCAATTGCGTGTATGCGTTGAATAAT GTGTATCTTGGCTTCTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCCATTATTATGTGGATTGTGTAT TTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAA ACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGGATGTATGTTAGGCCGATAATTGAG GACTACCATACCCTTACGGTCACAATAATACGTGGTCATCTTTACATGCAAGGTATAAAA CTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCAGATTTGCCAGCTTATGTGACTGTTGCTAAGGTCTCG CACCTGCTCACGTATAAGCGTGGTTTTCTTGACAAGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCT GTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGC TTGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAA >NC_001846_MHV_MHV-A59_M_28968..29654_687bp ATGAGTAGTACTACTCAGGCCCCAGAGCCCGTCTATCAATGGACGGCCGACGAGGCAGTT CAATTCCTTAAGGAATGGAACTTCTCGTTGGGCATTATACTACTCTTTATTACTATCATA CTACAGTTCGGTTACACGAGCCGTAGCATGTTTATTTATGTTGTGAAAATGATAATCTTG TGGTTAATGTGGCCACTGACTATTGTTTTGTGTATTTTCAATTGCGTGTATGCGCTAAAT AATGTGTATCTTGGATTTTCTATAGTGTTTACTATAGTGTCCATTGTAATCTGGATTATG TATTTTGTTAATAGCATAAGGTTGTTTATCAGGACTGGTAGCTGGTGGAGCTTCAACCCC GAAACAAACAACCTTATGTGTATAGATATGAAAGGTACCGTGTATGTTAGACCCATTATT GAGGATTACCATACACTAACAGCCACTATTATTCGTGGCCACCTCTACATGCAAGGTGTT AAGCTAGGCACCGGTTTCTCTTTGTCTGACTTGCCCGCTTATGTTACAGTTGCTAAGGTG TCACACCTTTGCACTTATAAGCGCGCATTCTTAGACAAGGTAGACGGTGTTAGCGGTTTT GCTGTTTATGTGAAGTCCAAGGTCGGAAATTACCGACTGCCCTCAAACAAACCGAGTGGC GCGGACACCGCATTGTTGAGAATCTAA >NC_007732_PHEV_VW572_M_28141..28833_693bp ATGAGTAGTCCAACTACACCAGTACCAGTTATTAGCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAA TTCCTAAAGGAATGGAATTTTTCTTTGGGTATAATAGTACTCTTTATCACAATCATACTT CAATTTGGATACACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGGTTATTCTGTGG CTCATGTGGCCTCTAACTATAATTTTAACTATCTTCAACTGCGTATACGCGTTGAATAAT GTGTACCTTGGCTTCTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCTATTATTATGTGGGTTGTTTAT TTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAA ACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGAATGTATGTTAGGCCGATTATTGAG GACTACCATACCCTCACTGCCACAATAATACGTGGCCACCTCTACATCCAAGGTATAAAA CTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCAGATTTGCCTGCTTATGTGACCGTTGCTAAGGTTACA CACCTGTGCACATATAAGCGTGGTTTTCTTGACAGGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCT GTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTATCGATTGCCTTCAACCCATAAGGGCTCAGGC ATGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAA >EF424621_AntelopeCoV_US/OH1/2003WD1418_M_28675..29367_693bp ATGAGTAGTGTAACTACACCAGCACCAGTTTACACCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAA TTCCTAAAGGAATGGAACTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAGTCATATTG CAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGATCATTTTGTGG CTTATGTGGCCCCTTACTATCATCTTAACTATTTTCAATTGCGTGTATGCGTTGAATAAT GTGTATCTTGGCTTCTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCCATTATCATGTGGATTGTGTAT TTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAA ACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGGATGTATGTTAGGCCGATAATTGAG GACTACCATACCCTTACGGTCACAATAATACGTGGTCATCTTTACATGCAAGGTATAAAA CTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCAGATTTGCCAGCTTATGTGACTGTTGCTAAGGTCTCG CACCTGCTCACGTATAAGCGTGGTTTTCTTGACAAGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCT GTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGC TTGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAA >EF424622_GiCoV_US/OH3-TC/2006_M_28659..29351_693bp ATGAGTAGTGTAACTACACCAGCACCAGTTTACACCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAA TTCCTAAAGGAATGGAACTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAGTCATATTG CAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGATCATTTTGTGG CTTATGTGGCCCCTTACTATCATCTTAACTATTTTCAATTGCGTGTATGCGTTGAATAAT GTGTATCTTGGCTTCTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCCATTATCATGTGGATTGTGTAT TTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAA ACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGGATGTATGTTAGGCCGATAATTGAG GACTACCATACCCTTACGGTCACAATAATACGTGGTCATCTTTACATGCAAGGTATAAAA CTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCAGATTTGCCAGCTTATGTGACTGTTGCTAAGGTCTCG CACCTGCTCACGTATAAGCGTGGTTTTCTTGACAAGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCT GTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGC TTGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAA >NC_004718_SARS-human_Tor2_M_26398..27063_666bp ATGGCAGACAACGGTACTATTACCGTTGAGGAGCTTAAACAACTCCTGGAACAATGGAAC CTAGTAATAGGTTTCCTATTCCTAGCCTGGATTATGTTACTACAATTTGCCTATTCTAAT CGGAACAGGTTTTTGTACATAATAAAGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACA CTTGCTTGTTTTGTGCTTGCTGCTGTCTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCG ATTGCAATGGCTTGTATTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCCTTCAGG CTGTTTGCTCGTACCCGCTCAATGTGGTCATTCAACCCAGAAACAAACATTCTTCTCAAT GTGCCTCTCCGGGGGACAATTGTGACCAGACCGCTCATGGAAAGTGAACTTGTCATTGGT GCTGTGATCATTCGTGGTCACTTGCGAATGGCCGGACACTCCCTAGGGCGCTGTGACATT AAGGACCTGCCAAAAGAGATCACTGTGGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTA GGAGCGTCGCAGCGTGTAGGCACTGATTCAGGTTTTGCTGCATACAACCGCTACCGTATT GGAAACTATAAATTAAATACAGACCACGCCGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTA CAGTAA >AY304488_SARS-civet_SZ16_M_26383..27048_666bp ATGGCAGACAACAGTACTATTACCGTTGAGGAGCTTAAACAACTCCTGGAACAATGGAAC CTAGTAATAGGTTTCCTATTCCTAGCCTGGATTATGTTACTACAATTTGCCTATTCTAAT CGGAATAGGTTTTTGTACATAATAAAGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACA CTTGCTTGCTTTGTGCTTGCTGCTGTCTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCG ATTGCAATGGCTTGTATTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCCTTCAGG CTGTTTGCTCGTACCCGCTCAATGTGGTCATTCAACCCAGAAACAAACATTCTTCTCAAT GTGCCTCTCCGGGGGACAATTGTGACCAGACCGCTCATGGAAAGTGAACTTGTCATTGGT GCTGTGATCATTCGTGGTCACTTGCGAATGGCCGGACACTCCCTAGGGCGCTGTGACATT AAGGACCTGCCAAAAGAGATCACTGTGGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTA GGAGCGTCGCAGCGTGTAGGCACTGATTCAGGTTTTGCTGCATACAACCGCTACCGTATT GGAAACTATAAATTAAATACAGACCACGCCGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTA CAGTAA >NC_009694_SARS-bat_HKU3-1_M_26339..27004_666bp ATGGCAGACAACGGTACAATTACTGTTGAGGAGCTTAAACAACTCCTGGAACAATGGAAT CTAGTAATAGGTTTCATTTTCCTTGCTTGGATTATGTTACTACAGTTTGCCTATTCCAAC CGGAACAGGTTTCTGTATATAATAAAGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACA CTTGCTTGCTTTGTGCTTGCTGCTGTTTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGAATTGCG ATTGCAATGGCTTGTATAGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCTTTCAGG CTGTTTGCTCGCACCCGCTCAATGTGGTCATTCAATCCAGAAACAAATATTCTTCTCAAT GTGCCTCTTCGGGGGACAATTCTGACCAGACCGCTCATGGAAAGTGAACTTGTCATTGGT GCTGTGATCATTCGTGGTCACTTGCGGATGGCTGGACACTCCCTTGGGCGCTGTGACATA AAGGACCTGCCAAAAGAGATTACGGTGGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTA GGAGCGTCGCAGCGTGTAGGCACTGATTCAGGTTTTGCTGCATACAACCGCTACCGAATT GGAAACTACAAACTAAATACAGACCATTCAGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTA CAGTAA >AY545919_SARS-badger_CFB/SZ/94/03_M_26377..27042_666bp ATGGCAGACAACAGTACTATTACCGTTGAGGAGCTTAAGCAACTCCTGGAACAATGGAAC CTAGTAATAGGTTTCCTATTCCTAGCCTGGATTATGTTACTACAATTTGCCTATTCTAAT CGGAACAGGTTTTTGTACATAATAAAGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACA CTTGCTTGCTTTGTGCTTGCTGCTGTCTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCG ATTGCAATGGCTTGTATTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCCTTCAGG CTGTTTGCTCGTACCCGCTCAATGTGGTCATTCAACCCAGAAACAAACATTCTTCTCAAT GTGCCTCTCCGGGGGACAATTGTGACCAGACCGCTCATGGAAAGTGAACTTGTCATTGGT GCTGTGATCATTCGTGGTCACTTGCGAATGGCCGGACACTCCCTAGGGCGCTGTGACATT AAGGACCTGCCAAAAGAGATCACTGTGGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTA GGAGCGTCGCAGCGTGTAGGCACTGATTCAGGTTTTGCTGCATACAACCGCTACCGTATT GGAAACTATAAATTAAATACAGACCACGCCGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTA CAGTAA >NC_009019_Bat-CoV-HKU4_B04f HKU41_M_28000..28659_660bp ATGTCGTCGAACGGTAGTCTTACCAAAGATGAGGTAGTAAATATTATTAAGGACTGGAAT TTTTCATGGTCCATAATATTCCTACTTATTACTATCGTACTCCAATATGGTTATCCATCT AGGAGTATGATGGTTTACGTCTTTAAGATGTTCATATTATGGCTTTTATGGCCAGCTTCT ATGGCACTGTCCATATTTAGTGCTATTTATCCTATTAGTTTATCATCCCAGATTATATCT GGCATTCTAGCAGCAATCTGTGCTGTTATGTGGCTAGCGTACTTTGTTCAGAGTATAAGG CTATTTATGCGCACTGGTTCCTGGTGGTCTTTTAATCCAGAATCTAATTGTCTGCTCAAT GTCCCAATCGGTGGTACAACAGTTGTTAGGCCCTTGGTCGAAGATTCGACTAGTGTTACT GCTGTTGTCAACGACGGTCATCTTAAGATGGCTGGTATGCACTTTGGTCGCTGTGACTAC GATAGACTTCCTATGGAAATCACCGTAGCCAAGCCCTCTGTGCTTATAGCACTTAAGATG GTTAAACGCCAATCATATGGTACAAATTCTGGTGTTGCCATATTCCATAGGTATAAAGCT GGTAATTATAGAAGACCTACTATTATACAAGATGAAGAACTTGCATTGCTTAGGGCATAG >NC_009020_Bat-CoV-HKU5_LMH3f HKU51_M_28166..28828_663bp ATGGCGTCTAGCAATGTTACCCTCTCTAATGATGAGGTTCTCAGGCTTGTTAAAGACTGG AATTTCACCTGGTCGGTGGTCTTCCTGCTCATTACAATCGTGCTCCAATATGGCTACCCA TCTAGGAGCATGTTTGTCTACGTCATCAAGATGTTTGTATTATGGCTACTTTGGCCAGCA TCAATGGCACTATCTATATTTTGTGCTGTCTATCCAATTGATCTAGCTTCCCAGATAATC TCTGGCATACTAGCTGCAACAAGCTGCGCGATGTGGATCTCCTACTTCGTGCAAAGCATT CGGCTGTTTATGCGTACTGGCTCTTGGTGGTCTTTCAACCCTGAGTCTAACTGTCTACTT AATGTTCCCATCGGAGGCACCACTGTTGTGCGACCACTTGTTGAAGACTCGACCAGTGTC ACTGCTGTGGTCACTGATGGCTACCTTAAGATGGCAGGCATGCATTTTGGTGCTTGCGAC TTTCAACGTCTACCCTCTGAGGTGACGGTCGCAAAACCAAATGTGCTGATAGCCCTGAAA ATGATTAAACGCCAAGCGTATGGTACAAATTCTGGTGTTGCTATTTATCATAGGTATAAG GCAGGCAACTATAGGAGGCCGCCCATTATACAAGACCAAGAACTCGCACTGCTAAGGGCT TAA >NC_009021_Bat-CoV-HKU9_BF_005I HKU91_M_25689..26357_669bp ATGTCTAATAATTGTACTAACACTGTGCCTCGTCCTGAGGTTATAGCTGCTTTAAAAGAC TGGAACTTTGCAGTTTCAGTCATATTGTTGTTTATAACCGTGCTATTGCAGTGGGGTTAT CCTTCTCGTTGTAAACCCATATGGGTTATCAAGATGTTTATACTTTGGTTACTATGGCCG TTGTCCATAGCGGCCGCTGTTTTTGCAGCTATACACCCAATCAATTCAGTTGCTTTTGGT TTTGCTATAGCTTTTGCCTGTATTTCAGGCATTATGTGGTTGAGCTATTTTATTAGCTCA TTCCGCCTACTCTGTAGGACAGGCTCAGCCTGGTCTTTTATGCCAGAAACTGATATGCTT ATTAACATACCCCTTTTAGGGCGTACTGTAACTAGGCCTATCATTTCAGACTCACCTGCT GTTCAATTTTTGATTATCAGAGGTGAGCTTAGGTTTGATGGTTTCACCCTAGGTCGTTGT GACCCGGGTGATATGCCTGACATTGTTACTATTGCTAGACCTAATGCATTGCACTGGTAT AAGCGAGCACTTACTCGCAATATGTATACTCGTTCAGCTATCCTTGTTTATATTAAATAC AAGGTTGGCAACCACCGTGTGCAGAATACCACAGAGGATGGTGATAGGTTAGCAATGTTT GTAGCTTAA >NC_001451_IBV_Beaudette_M_24505..25182_678bp ATGCCCAACGAGACAAATTGTACTCTTGACTTTGAACAGTCAGTTCAGCTTTTTAAAGAG TATAATTTATTTATAACTGCATTCTTGTTGTTCTTAACCATAATACTTCAGTATGGCTAT GCAACAAGAAGTAAGGTTATTTATACACTGAAAATGATAGTGTTATGGTGCTTTTGGCCC CTTAACATTGCAGTAGGTGTAATTTCATGTACATACCCACCAAACACAGGAGGTCTTGTC GCAGCGATAATACTTACAGTGTTTGCGTGTCTGTCTTTTGTAGGTTATTGGATCCAGAGT ATTAGACTCTTTAAGCGGTGTAGGTCATGGTGGTCATTTAATCCAGAATCTAATGCCGTA GGTTCAATACTCCTAACTAATGGTCAACAATGTAATTTTGCTATAGAGAGTGTGCCAATG GTGCTTTCTCCAATTATAAAGAATGGTGTTCTTTATTGTGAGGGTCAGTGGCTTGCTAAG TGTGAACCAGACCACTTGCCTAAAGATATATTTGTTTGTACACCGGATAGACGTAATATC TACCGTATGGTGCAGAAATATACTGGTGACCAAAGCGGAAATAAGAAAAGGTTTGCTACG TTTGTCTATGCAAAGCAGTCAGTAGATACTGGCGAGCTAGAAAGTGTAGCAACAGGAGGA AGTAGTCTTTACACATAA >AY646283_IBV-partridge_Partridge/GD/S14/2003_M_24340..25017_678bp ATGTCCAACAAGACAAATTGCACCCTTGATTCTGAGCAGGCTATTCTGCTCTTCAAGGAA TATAATCTATTTATAACCGCATTCCTATTGTTTATAACCATACTACTTCAGTATGGATAT GCAACTAGGAGTCGTTTTATTTACATACTGAAAATGATAGTGTTATGGTGCTTTTGGCCC CTTAACATTGCAGTAGGTATAATTTCATGTATATATCCACCAAACACGGGAGGTCTTGTC GCAGCGATAATACTTACCGTGTTTGCATGTCTATCCTTTGTAGGGTATTGGATACAGAGT ATTAGGCTCTTTAAGCGGTGCAGGTCTTGGTGGTCGTTTAACCCAGAGAGCAATGCCGTA GGTTCAATACTCCTAACTAATGGTCAACAATGTAATTTTGCTATAGAGAGTGTGCCAATG GTGCTTTCTCCAATTATTAAGAATGGTGGTCTTTATTGTGAAGGTCAGTGGCTTGCTAAG TGTGAACCAGACCACTTGCCTAAAGATATTTTTGTTTGCACACCTGATAGACGAAACATC TATCGTATGGTGCAGAAATACACTGGTGACCAAAGCGGAAATAAGAAAAGGTTTGCTACA TTTGTCTATGCCAAGCAGTCAGTAGACAGCGGAGAGCTGGAAAGTGTATCAACTAGTGTA GGTAGTCTTTACACATAA >AY641576_IBV-peafowl_Peafowl/GD/KQ6/2003_M_24448..25125_678bp ATGTCCAACGAGACAAATTGTACTCTTGACTTTGAACAGTCAGTTGAGCTTTTTAAAGAG TATAATTTATTTATAACTGCATTCTTGTTGTTCTTAACCATAATACTTCAGTATGGCTAT GCAACAAGAAGTAAGTTTATTTATATACTGAAAATGATAGTGTTATGGTGCTTTTGGCCC CTTAACATTGCAGTAGGTGTAATTTCATGTATATACCCACCAAACACAGGAGGTCTTGTC GCAGCGATAATACTTACAGTGTTTGCGTGTCTGTCTTTTGTAGGTTATTGGATCCAGAGT ATTAGACTCTTTAAGCGGTGTAGGTCATGGTGGTCATTTAACCCAGAATCTAATGCCGTA GGTTCAATACTCCTAACTAATGGTCAACAATGTAATTTTGCTATAGAGAGTGTGCCAATG GTGCTTTCTCCAATTATAAAGAATGGTGTTCTTTATTGTGAGGGTCAGTGGCTTGCTAAG TGTGAACCAGACCACTTGCCTAAAGATATATTTGTTTGTACACCGGATAGACGTAATATC TACCGTATGGTGCAGAAATATACTGGTGACCAAAGCGGAAATAAGAAACGGTTTGCTACG TTTGTCTATTCAAAGCAGTCAGTAGATACTGGCGAGCTAGAAAGTGTAGCAACAGGAGGG AGTAGTCTTTACACCTAA >NC_007447_BoTV-1_Breda 1_M_25758..26459_702bp ATGTTTGAGACCAATTATTGGCCCTTCCCTGATCAGGCTCCAAACCCATTTAATGCTCAA GTTGAGCAGTTATCAGCAACTGAAAATGTTTATATTTTTCTTACTACACTTTTTGGAATA CTCCAACTAGTGTATGTTATTTTTAAGTTGTTATGTACTATGTTTCCAGCTCTGCATTGG TCGCCTATATGGCGCGGTTTGGAGAATTTTTGGCTTTTCTTGAGTTTAGCATCCCTTGCA ATTGCCTATTGGTGGCTTCCCAGTATGACCTTTACTGGCTATTGGGCATTGACCATTATT GCCACCATTTTGGTTTTGATTATGTTGATAATGATGTTTGTTAAGTTTGTTAGTTTTGTT AGATTGTTTTATAGGACTGGAAGTTTTGCAATTGCTATACGGGGACCAATTGTGCTTGTT GCACTTGATGTTACCATTAAGCTTCATTGCACACCTTTTGCAATTCTTGTTAAGGAGGTT GGCAATATCTTTTATTTGTCAGAGTATTGCAATAAACCATTAACAGCTGCTCAGGTTGCT GCGTTGCGGATTTGTGTTGGCGGACAATGGTTTGCTTACACGCGGTCCACTACTACCAGC GCCGCTAAAGTAGCTGCAGCTAACAGCACTGCAAAATACCATCTTTTTGTGCTGCAAGGT GTTGCAGATTATACGCAATTGTCTAGTGTTAAGTTTGAGTAG